對於所謂分流影響，易方達基金董事長詹余引認為，短期來看，科創板新股上市換手率較高、成交量較大，可能對存量市場存在一定影響。但是，科創板實行投資者適當性管理制度，個人投資者參與科創板具備較高的日均資產規模以及交易經驗要求，資產規模50萬元以上的投資者占比僅14%左右，仍然較小。從動態角度看，科創板的推出為證券市場增加了優質上市公司數量，可吸引更多投資者和資金參與A股，整體上提升了市場活力與韌性。
嘉實基金總經理經雷也同樣表示，科創板並不會對主機板市場產生較大分流影響。他分析稱，科創板本身有一定的制度安排，實行投資者的適當性管理。除專業的機構投資者外，能夠參與科創板的個人投資者也都屬於半專業投資者，對市場和公司的基本面、行業發展，以及經營模式等會有一定深度的研究和自身的判斷。因此，“市場還是會重回基本面和價值判斷的。”經雷說。
川財證券研究所所長陳靂指出，市場整體的中長期趨勢並不會因新的板塊開市而改變。他給出了一組歷史資料，2004年6月25日中小板首批8只新股上市，上證綜指當日下跌1.87%。2009年10月30日創業板首批28只新股上市，上證綜指當天上漲1.20%。而在中小板和創業板開市後次日起，上證綜指均經歷了一段時間的反彈，相關股票的估值也會逐漸向基本面回歸。
信達證券研發中心副總經理劉景德認為，總體來講，科創板對主機板資金分流影響有限。從近幾日的滬市成交資料分析，他指出，科創板開市只是增加了交易額，對存量的主機板市場影響不大。劉景德還表示，市場後期的走勢將會逐步趨於平穩，主機板總體是探底回升，科創板後幾個交易日的震盪幅度會相對收窄，成交金額相對也會少一些。
陳靂則認為，科創板企業平均市值較小，對應的募集資金規模也較小，對於存量市場的分流效應有限。同時，在當前的制度下，新股申購預先繳款早已取消，科創板也採取信用申購的方式，無需提前繳付申購資金，有效地控制了分流效應。
陳靂還指出，科創板是全新的戰略板塊，最終表現如何要看市場選擇。科創板新股開市首日的火爆表現，有望提升對電子、醫藥生物及新材料等A股相關標的的關注度，可能提升相關行業整體估值水準。
詹餘引也認為，長期來看，股票價格終將回歸企業價值，隨著市場各方充分交易，科創板將逐步形成均衡價格並回歸企業價值，各板塊之間的影響將弱化。板塊內部的公司表現也將分化，質地優秀、估值合理或偏低的企業將長期勝出，而估值高、質地差的企業將在長跑中逐步落後。
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